2045 год. Мир захлестнула Четвертая промышленная революция, получившая название «Синдром устойчивой войны». Глобальная экономика рухнула, и единственным способом выживания для государств стало ведение бесконечных, но ограниченных по масштабу конфликтов. Люди, не выдержавшие информационной перегрузки и тотальной цифровизации, массово страдают от «Синдрома одиночки» — психического расстройства, при котором человек перестает воспринимать реальность как общую, замыкаясь в собственном перцептивном пузыре. В этом хаосе майор Мотоко Кусанаги, обладающая полностью кибернетическим телом, собирает разрозненных членов своего старого отряда 9-го отдела. Они становятся наемниками, работающими за деньги, но их истинная цель — найти свое место в мире, где грань между человеком и машиной, реальностью и симуляцией стерта окончательно.
Их первое крупное дело — поимка «Нового человека», обладающего способностью взламывать кибермозги без физического подключения, что считается невозможным. Преследуя его, команда сталкивается с таинственной организацией «Позитрон», которая, похоже, стоит за созданием этого феномена. Постепенно выясняется, что «Синдром одиночки» — не просто болезнь, а побочный эффект эксперимента по созданию коллективного бессознательного, гигантской сети, способной объединить все человеческие сознания. Кусанаги и ее команда оказываются втянуты в гонку со временем: с одной стороны, корпорации и правительства пытаются взять под контроль эту технологию, чтобы манипулировать массами, с другой — «Новый человек» стремится освободить всех от оков индивидуальности, предлагая утопию полного слияния. Вопрос, который мучает майора, становится экзистенциальным: что есть «я», если мои воспоминания, чувства и даже личность могут быть взломаны, стерты или объединены с миллионами других? Сможет ли она сохранить свою уникальность в мире, где одиночество стало проклятием, а слияние — единственным спасением?