Третий сезон «Великого из бродячих псов» начинается с того, что Ацуши Накаджима и его коллеги по Вооруженному детективному агентству оказываются втянуты в водоворот событий, корни которых уходят в прошлое. Всё начинается с таинственного исчезновения президента агентства, Фукудзавы, и появления загадочного человека по имени Фёдор Достоевский, чьи планы грозят уничтожить не только Йокогаму, но и весь мир. Параллельно раскрывается история происхождения Осаму Дадзая и его бывшего напарника по Портовой мафии, Чуи Накахары. Зритель переносится на четыре года назад, когда Дадзай, тогда ещё один из самых опасных мафиози, решает завербовать юного Чую, обладающего разрушительной способностью «Печаль Бога». Их первая совместная миссия против незаконной торговли оружием оборачивается жестокой проверкой на прочность, где каждый шаг грозит предательством. В настоящем же времени Ацуши и его друзья пытаются расшифровать послание, оставленное президентом, и сталкиваются с новым врагом — организацией «Крысиный король», которая манипулирует людьми с помощью способностей. Напряжение нарастает, когда выясняется, что исчезновение Фукудзавы связано с его прошлым в качестве телохранителя и с тайной, которую он хранил десятилетиями.
Во второй половине сезона сюжет делает резкий поворот, фокусируясь на противостоянии между Агентством и Портовой мафией, которых Достоевский сталкивает лбами. Чуя, всё ещё помнящий о предательстве Дадзая, вынужден объединиться с ним, чтобы спасти Йокогаму от гигантского чудовища, созданного способностью «Книга». Ацуши, в свою очередь, проходит через внутренний кризис, узнав правду о своём прошлом в приюте и о том, как его способность «Тигр Бякуя» связана с древним артефактом. Кульминацией становится битва на крыше небоскреба, где Дадзай раскрывает свой истинный план по уничтожению Достоевского, жертвуя собственной свободой. Финал оставляет зрителя с горьким послевкусием: хотя угроза временно устранена, Агентство оказывается под подозрением правительства, а Дадзай исчезает при загадочных обстоятельствах. Третий сезон мастерски переплетает экшен с психологической драмой, показывая, как далеко готовы зайти герои ради тех, кого они считают семьёй, и какую цену приходится платить за доверие в мире, где каждый может оказаться врагом.
