В небе над Токио без предупреждения возникает гигантская сияющая сфера. Её называют «Небесным куполом». Она не атакует, не общается, просто парит, нарушая все законы физики и погружая мир в состояние парализующего трепета. Правительства и учёные бессильны, а человечество замерло в ожидании. Но ожидание заканчивается, когда от купола начинают отделяться причудливые сущности — не машины и не органические существа, а словно материализованные геометрические кошмары. Их вторжение не похоже на войну; это холодный, методичный процесс трансформации реальности. Они не уничтожают города, а перестраивают их, превращая знакомые улицы в абсурдные лабиринты из света и неземных материалов. Люди в зоне поражения не погибают, а просто... исчезают, будто стёртые ластиком.
Сопротивление возглавляет не солдат, а молчаливого гения-нейробиолога Кирито Маэду. Он обнаруживает, что «купол» воздействует на само человеческое сознание, переписывая восприятие и память. Единственный ключ к борьбе — редкая группа людей, чей мозг в силу уникальных травм или генетики оказывается невосприимчивым к этому влиянию. Среди них — девушка Аой, чьи сны странным образом отражают внутреннюю логику вторжения. Собрав этих «Иммунных», Кирито ведёт их в самое сердце изменённого Токио. Их оружие — не пушки, а сфокусированная человеческая воля и хрупкая связь между их разумами. Они вынуждены сражаться не с чужаками, а с самой реальностью, которая каждый миг пытается стереть их из существования, искать слабые места в системе, которая считает их всего лишь ошибкой в коде. Их цель — не разрушить купол, а понять его истинную природу, рискуя в этом путешествии потерять саму свою человеческую сущность.
